AI技术辅助普言生物蛋白高效设计 探索更多应用场景-新华网
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2024 09/03 13:10:26
来源:新华网

AI技术辅助普言生物蛋白高效设计 探索更多应用场景

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  日前广东普言生物科技有限公司(以下简称“普言生物”)荣获第九届“创客中国”广东省中小企业创新创业大赛暨第八届“创客广东”大赛生物医药与健康领域专题决赛铜奖;另8月13日普言生物也获得2024年第十三届中国创新创业大赛(广东·中山赛区)暨第八届中山市科技创新创业大赛决赛三等奖。

  “普言生物是一家聚焦合成生物学技术创新与工业化开发重组功能蛋白的科技公司。我们在不到2年时间内完成10多种功能蛋白的研发及量产并搭建了中试平台和生物工厂我们高效的研发能力和绿色低耗的产线可以为客户提供增值服务。”普言生物CEO介绍“人工智能(AI)技术的持续投入与应用使我们在蛋白设计和功效上获得更多优势

  近几年人工智能(AI)技术的发展赋予蛋白设计更广泛的应用潜力。这些模型对现有蛋白序列进行深度学习并通过算法对数据及模型持续优化、迭代挖掘并生成具有特定功能、活性的序列及其与细胞系统的潜在互作关系极大提升了蛋白设计的效率与产业化能力。

  “基于AI和蛋白质的特点我们从几方面实现AI的蛋白质设计应用。首先从各大数据中心收集、归纳和分类构建得到数据量达105-109的蛋白质序列、结构、功能、互作网络等数据库以及各种特定蛋白质(如胶原蛋白)的数据库。第二我们根据开发需求构建了两个基本的AI模型:基于卷积神经网络(CNN)的多模态(multimodal)、多轨(multitrack)深度学习模型可以有效理解蛋白序列、理化特性与功能的高维内在关系实现对某一特定蛋白进行每天超亿级别序列的超精确计算分析。第三我们采用更适于生物学的指标如精确率、召回率、F1分数、准确率、Matthews相关系数(MCC)等提高AI模型训练的有效性、高效性以及准确性实现更低的算力获得更高的算量。第四基于我们建立的合成生物学技术平台实现AI与合成生物学技术融合可以对计算预测的蛋白质进行快速合成、高通量筛选和评估并形成具有精细注释的实体数据实现对数据库和模型训练的更新迭代使AI模型具有强的自我进化能力从而获得高活性、高表达量及高稳定性的功能蛋白。”普言生物CEO介绍

  普言生物将继续致力于人工智能(AI)技术在合成生物领域的应用发展推动算法模型与工程进一步融合并探索更多蛋白设计的可能性与应用场景从而满足更广泛的个性化产业应用需求为合成生物产业挖掘新的价值点。

【纠错】 【责任编辑:刘觅觅】