日前,广东普言生物科技有限公司(以下简称“普言生物”)荣获第九届“创客中国”广东省中小企业创新创业大赛暨第八届“创客广东”大赛生物医药与健康领域专题决赛铜奖;另8月13日,普言生物也获得2024年第十三届中国创新创业大赛(广东·中山赛区)暨第八届中山市科技创新创业大赛决赛三等奖。
“普言生物是一家聚焦合成生物学技术创新与工业化,开发重组功能蛋白的科技公司。我们在不到2年时间内完成10多种功能蛋白的研发及量产,并搭建了中试平台和生物工厂,我们高效的研发能力和绿色低耗的产线可以为客户提供增值服务。”普言生物CEO介绍,“人工智能(AI)技术的持续投入与应用,使我们在蛋白设计和功效上获得更多优势。”
近几年,人工智能(AI)技术的发展赋予蛋白设计更广泛的应用潜力。这些模型对现有蛋白序列进行深度学习,并通过算法对数据及模型持续优化、迭代,挖掘并生成具有特定功能、活性的序列及其与细胞系统的潜在互作关系,极大提升了蛋白设计的效率与产业化能力。
“基于AI和蛋白质的特点,我们从几方面实现AI的蛋白质设计应用。首先,从各大数据中心收集、归纳和分类,构建得到数据量达105-109的蛋白质序列、结构、功能、互作网络等数据库,以及各种特定蛋白质(如胶原蛋白)的数据库。第二,我们根据开发需求构建了两个基本的AI模型:基于卷积神经网络(CNN)的多模态(multimodal)、多轨(multitrack)深度学习模型,可以有效理解蛋白序列、理化特性与功能的高维内在关系,实现对某一特定蛋白进行每天超亿级别序列的超精确计算分析。第三,我们采用更适于生物学的指标,如精确率、召回率、F1分数、准确率、Matthews相关系数(MCC)等,提高AI模型训练的有效性、高效性以及准确性,实现更低的算力获得更高的算量。第四,基于我们建立的合成生物学技术平台,实现AI与合成生物学技术融合,可以对计算预测的蛋白质进行快速合成、高通量筛选和评估,并形成具有精细注释的实体数据,实现对数据库和模型训练的更新迭代,使AI模型具有强的自我进化能力,从而获得高活性、高表达量及高稳定性的功能蛋白。”普言生物CEO介绍。
普言生物将继续致力于人工智能(AI)技术在合成生物领域的应用发展,推动算法模型与工程进一步融合,并探索更多蛋白设计的可能性与应用场景,从而满足更广泛的个性化产业应用需求,为合成生物产业挖掘新的价值点。



